UIN Antasari memiliki 28 program studi dengan lokasi perkuliahan di Banjarmasin dan Banjarbaru. Seleksi penerimaan mahasiswa baru di perguruan tinggi keagamaan Islam negeri (PTKIN) dibuka melalui 3 jalur, yaitu Seleksi Prestasi Akademik Nasional (SPAN), Ujian Masuk (UM), dan Ujian Mandiri. Sedangkan untuk prodi umum, akan mengikuti seleksi lewat jalur Kemendikbudristek, yakni Seleksi Nasional Berbasis Prestasi, dan Seleksi Nasional Berbasi Tes.